O Parque Natural da Ilha de Santa Maria foi criado pelo Decreto Legislativo Regional n.º 47/2008/A, de 7 de novembro, alterado pelo Decreto Legislativo Regional n.º 39/2012/A, de 19 de setembro, e instituiu 13 áreas protegidas:

    - [SMA01] Reserva Natural dos Ilhéus das Formigas

    - [SMA02] Reserva Natural do Ilhéu da Vila

    - [SMA03] Monumento Natural da Pedreira do Campo, do Figueiral e Prainha

    - [SMA04] Área Protegida para a Gestão de Habitats ou Espécies da Costa Sudoeste

    - [SMA05] Área Protegida para a Gestão de Habitats ou Espécies da Ponta do Castelo

    - [SMA06] Área Protegida para a Gestão de Habitats ou Espécies da Baía do Cura

    - [SMA07] Área Protegida para a Gestão de Habitats ou Espécies do Pico Alto

    - [SMA08] Área de Paisagem Protegida do Barreiro da Faneca

    - [SMA09] Área de Paisagem Protegida da Baía de São Lourenço

    - [SMA10] Área de Paisagem Protegida da Baía da Maia

    - [SMA11] Área Protegida de Gestão de Recursos da Baía de São Lourenço
 
    - [SMA12] Área Protegida de Gestão de Recursos da Costa Norte

    - [SMA13] Área Protegida de Gestão de Recursos da Costa Sul


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