O Parque Natural da Ilha de São Miguel foi criado pelo Decreto Legislativo Regional n.º 19/2008/A, de 8 de julho, e institui 23 áreas protegidas:
- [SMG01] Reserva Natural da Lagoa do Fogo
- [SMG02] Reserva Natural do Pico da Vara
- [SMG03] Monumento Natural da Caldeira Velha
- [SMG04] Monumento Natural da Gruta do Carvão
- [SMG05] Monumento Natural do Pico das Camarinhas - Ponta da Ferraria
- [SMG06] Área Protegida para a Gestão de Habitats ou Espécies do Ilhéu de Vila Franca do Campo
- [SMG07] Área Protegida para a Gestão de Habitats ou Espécies da Serra de Água de Pau
- [SMG08] Área Protegida para a Gestão de Habitats ou Espécies da Tronqueira e Planalto dos Graminhais
- [SMG09] Área Protegida para a Gestão de Habitats ou Espécies da Ponta do Cintrão
- [SMG10] Área Protegida para a Gestão de Habitats ou Espécies da Ponta do Arnel
- [SMG11] Área Protegida para a Gestão de Habitats ou Espécies das Feteiras
- [SMG12] Área Protegida para a Gestão de Habitats ou Espécies da Ponta do Escalvado
- [SMG13] Área Protegida para a Gestão de Habitats ou Espécies da Ponta da Bretanha
- [SMG14] Área Protegida para a Gestão de Habitats ou Espécies do Faial da Terra
- [SMG15] Área Protegida para a Gestão de Habitats ou Espécies da Ferraria
- [SMG16] Área Protegida para a Gestão de Habitats ou Espécies da Lagoa do Congro
- [SMG17] Área de Paisagem Protegida das Sete Cidades
- [SMG18] Área de Paisagem Protegida das Furnas
- [SMG19] Área Protegida de Gestão de Recursos da Caloura - Ilhéu de Vila Franca do Campo
- [SMG20] Área Protegida de Gestão de Recursos da Costa Este
- [SMG21] Área Protegida de Gestão de Recursos da Ponta do Cintrão - Ponta da Maia
- [SMG22] Área Protegida de Gestão de Recursos do Porto das Capelas - Ponta das Calheta
- [SMG23] Área Protegida de Gestão de Recursos da Ponta da Ferraria - Ponta da Bretanha
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