O SCUT, implementado na ilha de São Miguel, promove a intersecção de vários cursos de água, o que criou a necessidade de adoção de estruturas convenientes para o seu atravessamento. A Administração Hidrográfica dos Açores vem acompanhando a conceção e execução deste projeto, tendo emitido licenças de utilização dos recursos hídricos após a avaliação das soluções propostas para cada caso e respetivos dimensionamentos para garantia de escoamentos em situações extraordinárias.
Em Dezembro de 2011, numa fase em que as vias já se encontram abertas ao tráfego e em que decorrem ainda obras de acabamentos periféricos, foi feita uma avaliação geral das condições da totalidade dos viadutos e de cerca de 55% das passagens hidráulicas do projeto. Assim, avaliaram-se 25 viadutos e um total de 91 passagens hidráulicas em cerca de 31,6 km de via, tendo sido verificada a existência de alterações ao projeto, estabilidade nas áreas alvo de intervenção, e, principalmente, se as drenagens estavam finalizadas e funcionais.
Concluiu-se que os projetos foram cumpridos na generalidade, embora algumas soluções tenham sido ajustadas localmente sem prejuízo das secções de escoamento necessárias. Existem ainda várias zonas com obras a decorrer, nomeadamente com a execução de caminhos paralelos e restabelecimentos, pelo que foram identificadas algumas situações a corrigir, tendo a entidade responsável pela via sido alertada em conformidade.
Tendo em conta a sua abrangência geográfica, este projeto será acompanhado continuamente, no sentido de garantir que as condições de escoamento se mantêm devidamente funcionais.